La Contaduría General está integrada por:
Contador General
Contador Adjunto de Control Interno y Auditorias
Cuerpo de Contadores Delegados
Secretaría Técnica y Auditorias Especiales
Contador Adjunto de Contabilidad y Sistemas
Área Contabilidad
Área Bienes y Acreencias
Área Informática
Área de Metodología y Coordinación de Sistemas de Ia Información
Área de Análisis de Ia Información Financiera
Asesoría Jurídica
Área Deuda Pública Consolidada
Área Informes Generales y Coparticipación a Municipios
Área Secretaría General